質(zhì)粒存在于許多細(xì)菌以及酵母菌等生物中,是細(xì)胞染色體外能夠自主復(fù)制的很小的環(huán)狀DNA分子。在基因工程中,質(zhì)粒制備可將質(zhì)粒作為目的基因的載體,在新的宿主生物體中正常表達(dá)。質(zhì)粒DNA可以作為疫苗或治療性藥物單獨使用,或在病毒載體生產(chǎn)中作為病毒包裝的原料。
質(zhì)粒制備的步驟
質(zhì)粒制備流程圖
質(zhì)粒制備常見問題
Q:轉(zhuǎn)化后克隆數(shù)量少
A:可以設(shè)置陰性和陽性對照。克隆過程中,陰性對照-空載長出菌落,判定可能是酶切不完全導(dǎo)致,陽性對照不出斑,可能是轉(zhuǎn)化實驗的操作出現(xiàn)問題。感受態(tài)細(xì)胞切勿反復(fù)凍融,且熱激時間一定要精準(zhǔn)到秒,同時正確使用抗生素或其他篩選標(biāo)記。
Q:菌落太多但假陽性率高,挑不到正確克隆
A:菌落PCR鑒定引物需跨區(qū)域設(shè)計,一條引物設(shè)計在載體上,另外一條在目標(biāo)片段上。如此可避免假陽性克隆又篩除反向插入片段,還可以通過提取質(zhì)粒酶切跑膠進(jìn)一步排除錯誤克隆。
Q:大腸桿菌老化
A:建議涂布平板培養(yǎng)后,重新挑選新菌落進(jìn)行液體培養(yǎng)。
Q:質(zhì)粒未全部溶解
A:洗脫溶解質(zhì)粒時,可適當(dāng)加溫或延長溶解時間。
Q:質(zhì)粒提取不成功
A:裂解時間過長,一般不應(yīng)超過5分鐘。吸附時間,溶解時間不夠都會導(dǎo)致質(zhì)粒DNA提取實驗失敗。
質(zhì)粒制備|泓迅生物
泓迅生物擁有完善的質(zhì)粒制備生產(chǎn)線,確保提供無RNA污染、無基因組污染的高質(zhì)量無菌質(zhì)粒,可將內(nèi)毒素含量控制在較低水平(< 100EU/mg、<30EU/mg、<5EU/mg,供選擇)。另外我們還提供序列驗證、限制酶酶切和內(nèi)毒素分析等服務(wù),滿足各領(lǐng)域客戶多樣化的下游應(yīng)用,如轉(zhuǎn)染、抗體制備,疫苗和基因治療研究等。
案例分享——轉(zhuǎn)染級質(zhì)粒制備
將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后挑取單克隆菌落進(jìn)行培養(yǎng),抽提菌液進(jìn)行酶切及測序驗證,對符合要求的質(zhì)粒進(jìn)行大批量接菌抽提,之后對各批次抽提質(zhì)粒進(jìn)行酶切驗證,無誤后混合所有抽提質(zhì)粒,最后對大抽質(zhì)粒進(jìn)行去內(nèi)毒素處理,48h細(xì)菌檢測如圖1所示。
圖1 內(nèi)毒素檢測
內(nèi)毒素檢測結(jié)果為陰性對照不凝固,陽性對照凝固,測試稀釋樣品不凝固,標(biāo)準(zhǔn)品不凝固,證明去內(nèi)毒素處理成功。
經(jīng)過細(xì)菌檢測結(jié)果比對,48h無抗培養(yǎng)基均不長斑,通過無菌檢測。