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質(zhì)粒制備常見問題解答和案例分享
發(fā)布時(shí)間:2024-10-14

質(zhì)粒存在于許多細(xì)菌以及酵母菌等生物中,是細(xì)胞染色體外能夠自主復(fù)制的很小的環(huán)狀DNA分子。在基因工程中,質(zhì)粒制備可將質(zhì)粒作為目的基因的載體,在新的宿主生物體中正常表達(dá)。質(zhì)粒DNA可以作為疫苗或治療性藥物單獨(dú)使用,或在病毒載體生產(chǎn)中作為病毒包裝的原料。


質(zhì)粒制備的步驟

 

質(zhì)粒制備流程圖


質(zhì)粒制備常見問題

Q:轉(zhuǎn)化后克隆數(shù)量少

A:可以設(shè)置陰性和陽(yáng)性對(duì)照??寺∵^程中,陰性對(duì)照-空載長(zhǎng)出菌落,判定可能是酶切不完全導(dǎo)致,陽(yáng)性對(duì)照不出斑,可能是轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)的操作出現(xiàn)問題。感受態(tài)細(xì)胞切勿反復(fù)凍融,且熱激時(shí)間一定要精準(zhǔn)到秒,同時(shí)正確使用抗生素或其他篩選標(biāo)記。


Q:菌落太多但假陽(yáng)性率高,挑不到正確克隆

A:菌落PCR鑒定引物需跨區(qū)域設(shè)計(jì),一條引物設(shè)計(jì)在載體上,另外一條在目標(biāo)片段上。如此可避免假陽(yáng)性克隆又篩除反向插入片段,還可以通過提取質(zhì)粒酶切跑膠進(jìn)一步排除錯(cuò)誤克隆。


Q:大腸桿菌老化

A:建議涂布平板培養(yǎng)后,重新挑選新菌落進(jìn)行液體培養(yǎng)。


Q:質(zhì)粒未全部溶解

A:洗脫溶解質(zhì)粒時(shí),可適當(dāng)加溫或延長(zhǎng)溶解時(shí)間。


Q:質(zhì)粒提取不成功

A:裂解時(shí)間過長(zhǎng),一般不應(yīng)超過5分鐘。吸附時(shí)間,溶解時(shí)間不夠都會(huì)導(dǎo)致質(zhì)粒DNA提取實(shí)驗(yàn)失敗。

 

質(zhì)粒制備|泓迅生物

泓迅生物擁有完善的質(zhì)粒制備生產(chǎn)線,確保提供無(wú)RNA污染、無(wú)基因組污染的高質(zhì)量無(wú)菌質(zhì)粒,可將內(nèi)毒素含量控制在較低水平(< 100EU/mg、<30EU/mg、<5EU/mg,供選擇)。另外我們還提供序列驗(yàn)證、限制酶酶切內(nèi)毒素分析等服務(wù),滿足各領(lǐng)域客戶多樣化的下游應(yīng)用,如轉(zhuǎn)染、抗體制備,疫苗和基因治療研究等。


案例分享——轉(zhuǎn)染級(jí)質(zhì)粒制備

將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后挑取單克隆菌落進(jìn)行培養(yǎng),抽提菌液進(jìn)行酶切及測(cè)序驗(yàn)證,對(duì)符合要求的質(zhì)粒進(jìn)行大批量接菌抽提,之后對(duì)各批次抽提質(zhì)粒進(jìn)行酶切驗(yàn)證,無(wú)誤后混合所有抽提質(zhì)粒,最后對(duì)大抽質(zhì)粒進(jìn)行去內(nèi)毒素處理,48h細(xì)菌檢測(cè)如圖1所示。


 

圖1 內(nèi)毒素檢測(cè)


內(nèi)毒素檢測(cè)結(jié)果為陰性對(duì)照不凝固,陽(yáng)性對(duì)照凝固,測(cè)試稀釋樣品不凝固,標(biāo)準(zhǔn)品不凝固,證明去內(nèi)毒素處理成功。


圖2細(xì)菌檢測(cè)結(jié)果比對(duì)



經(jīng)過細(xì)菌檢測(cè)結(jié)果比對(duì),48h無(wú)抗培養(yǎng)基均不長(zhǎng)斑,通過無(wú)菌檢測(cè)。

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