熒光分子探針具有結(jié)構(gòu)可變,合成簡單和易于修飾等特點,被廣泛應用于核酸、酶、蛋白質(zhì)及細胞等生物分析物的檢測中,是分子診斷中不可或缺的研究工具。隨著PCR檢測技術(shù)的發(fā)展,對熒光探針的靈敏度、熒光強度、背景信號等指標要求也越來越高。當qPCR探針長,信噪比差時,該怎么辦呢?
新品推薦—雙淬滅探針
隨著探針長度的增加,單淬滅探針的淬滅效果減弱,雙淬滅探針的出現(xiàn)很好的解決了這個問題。常規(guī)探針在 5' 端有一個熒光基團,在 3' 端有一個淬滅基團。泓迅科技雙淬滅探針在常規(guī)探針內(nèi)部增加一個淬滅基團,減少熒光“泄露”現(xiàn)象,在實驗中可獲得更低的熒光背景信號,提高檢測的靈敏度。
雙淬滅探針
泓迅科技雙淬滅探針與淬滅基團選擇列表
通常情況下,SYNO Q1 用于在480-580nm范圍內(nèi)的淬滅,可與常用熒光基團配合使用,如FAM、VIC和HEX等;SYNO Q2 用于在550-650nm范圍內(nèi)的淬滅,如ROX、TXR、TAMRA、CY5和ATTO 647等熒光基團最為有效。
為什么選擇雙淬滅探針?
高質(zhì)量的熒光探針可顯著提高試驗效率和檢測準確性。熒光探針的評價標準主要包括:選擇性、靈敏度、響應速度、熒光增強倍數(shù)、穩(wěn)定性和生物相容性等。常規(guī)核酸探針只有一種效應淬滅熒光!淬滅基團對熒光基團的淬滅能力是有距離限制的,當淬滅基團與熒光基團距離較近時,淬滅效果好,當淬滅基團與熒光探針距離較遠時,淬滅效果差,背景熒光信號會增強。雙淬滅探針可有效解決“距離”問題,讓qPCR試驗如虎添翼!
雙淬滅機制有效降低背景信號,提高靈敏度
減少多通道檢測中熒光信號串擾,具有兼容性
探針長度設(shè)計可達40nt,具備更好的選擇性
性能 |
常規(guī)探針 |
雙淬滅探針 |
適用長度 |
<30nt |
<45nt |
降低背景信號 |
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靈敏度 |
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多重PCR適用性 |
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常規(guī)探針與雙淬滅探針對比
雙淬滅探針的應用
雙淬滅TaqMan探針應用于新型冠狀病毒核酸檢測的初步研究
伍嘉豪, 張嫦麗, 王嫻默, 范文, 易華偉
在核酸檢測中,由于采樣和qPCR靈敏度問題,假陰性結(jié)果經(jīng)常發(fā)生。為了提升對SARS-CoV-2核酸的檢測效果,研究人員開發(fā)了一種雙淬滅TaqMan探針,其含有兩個淬滅基團。與單淬滅TaqMan探針相比,雙淬滅TaqMan探針的背景熒光信號更低(161±9 vs 290±18)。此外,研究表明,雙淬滅TaqMan探針檢測系統(tǒng)具有更好的檢測精度(CV 1.4% vs 2.3%; 0.6% vs 2.1%)和更低的檢測下限。
單淬滅和雙淬滅 TaqMan 探針示意圖及探針的熒光信號檢測
雙淬滅熒光探針在腸癌患者腸道菌群qPCR檢測中的應用
臧彩霞,奚曉華,朱會芳等
研究者探討了雙淬滅熒光探針在腸癌患者腸道菌群熒光定量(qPCR)檢測中的應用效果。通過接受手術(shù)的42例腸癌患者研究組與健康體檢成人38例對照組,收集標本,用常規(guī) qPCR和雙淬熒光探針qPCR檢測腸道菌群的表達量。結(jié)果研究組的膽汁酸、血清總膽汁酸、次級膽汁酸均高于對照組(P<0.05)。研究表明,雙淬滅熒光探針檢測腸道菌群、 膽汁酸的方法便捷,結(jié)果準確,對鑒別及篩查早期腸癌患者有指導意義,值得臨床推廣。
參考文獻
[1] Marras SA, Kramer FR, Tyagi S. Efficiencies of fluorescence resonance energy transfer and contact-mediated quenching in oligonucleotide probes. Nucleic Acids Res. 2002 Nov 1;30(21):e122.
[2] 伍嘉豪, 張嫦麗, 王嫻默, 范文, 易華偉. 雙淬滅TaqMan探針應用于新型冠狀病毒核酸檢測的初步研究[J]. 病毒學報, 2022, 38 (04): 784-790.
[3] 臧彩霞,奚曉華,朱會芳等.雙淬滅熒光探針在腸癌患者腸道菌群qPCR檢測中的應用[J].臨床醫(yī)學工程,2023,30(09):1199-1200.
[4] 張園,張海霞.核酸探針及其在生物分析中的應用[J].分析試驗室,2020,39(09):1002-1012.