5'Aminolinker(C6)是在合成循環(huán)的最后一步以亞磷酸胺的形式通過B-氰乙基化學(xué)反應(yīng)添加到引物5'糖環(huán)上的,而不是添加到最后一個(gè)堿基上。
5'氨基標(biāo)準(zhǔn)的偶聯(lián)效率是>95%,氨基基團(tuán)在260nm處是沒有吸光值的;它在210nm處有吸光值。不能通過電泳檢測(cè)它的存在(瓊脂糖或丙烯酰胺)。
3'Aminolinker(C7)只與一些5'修飾兼容,如FAM, HEX, TET, Fluorescein, Biotin, Amine, and phosphate。其它的5'修飾(如Alexa dyes)需要氨基才能與寡核苷酸相連,這就無法避免該染料與3'氨基相連。
氨基修飾是很簡單便宜的方法。任意一種氨基修飾都可以。5'末端C6類型效果很好。