常見的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)平臺(tái)包括Illumina HiSeq、NovaSeq和BioNano Genomics等。Illumina平臺(tái)因其高通量和高準(zhǔn)確性而廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄組測序。

參考基因組選擇：根據(jù)具體研究目的和樣本特點(diǎn)選擇最適合的參考基因組。對于高變異的樣本，可以選擇一致性較高的參考基因組進(jìn)行比對。

比對率低：選擇合適的比對工具（如Bowtie、BWA等）進(jìn)行比對。

常用的SNP檢測方法包括直接測序法、Taqman探針法、HRM法、焦磷酸測序法、SNaPShot和Sequenom法等。

需要確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性，使用適當(dāng)?shù)能浖M(jìn)行數(shù)據(jù)分析，仔細(xì)檢查突變位點(diǎn)和相關(guān)序列。

可以鑒定細(xì)菌、真菌等微生物，包括病原菌和環(huán)境微生物。

樣品可以是細(xì)菌或真菌的純培養(yǎng)物（菌液、菌株），或環(huán)境樣品（如土壤、水樣等）。

答：溶解DNA測序樣品時(shí)，用滅菌蒸餾水溶解最好。DNA的測序反應(yīng)也是Taq酶的聚合反應(yīng)，需要一個(gè)最佳的酶反應(yīng)條件。如果DNA用緩沖液溶解后，在進(jìn)行了測序反應(yīng)時(shí)，DNA溶液中的緩沖液組份會(huì)影響測序反應(yīng)的體系條件，造成Taq酶的聚合性能下降。 有很多客戶在溶解DNA測序樣品時(shí)使用TE Buffer。的確，TE Buffer能增加DNA樣品保存期間的穩(wěn)定性， 但TE Buffer對DNA測序反應(yīng)有影響，根據(jù)我們的經(jīng)驗(yàn)，我們還是推薦使用滅菌蒸餾水來溶解DNA測序樣品。

答：我們推薦客戶提供菌體，由我們來提取質(zhì)粒，這樣DNA樣品比較穩(wěn)定。如果您要以提供DNA樣品，我們也很歡迎，但一定要注意樣品純度和數(shù)量。提供的測序樣品為PCR產(chǎn)物時(shí)，特別需要注意DNA的純度和數(shù)量。PCR產(chǎn)物應(yīng)該進(jìn)行切膠回收，否則無法得到良好的測序效果。有關(guān)DNA測序樣品的詳細(xì)情況請嚴(yán)格參照“DNA測序樣品準(zhǔn)備及注意事項(xiàng)”部分的說明。

答：一般菌體的形態(tài)有：平板培養(yǎng)菌、穿刺培養(yǎng)菌，甘油保存菌或新鮮菌液等。我們提倡寄送穿刺培養(yǎng)菌或新鮮菌液。平板培養(yǎng)菌運(yùn)送特別不方便，我們收到的一些平板培養(yǎng)菌的培養(yǎng)皿在運(yùn)送過程中常常已經(jīng)破碎，面目全非，需要用戶重新寄樣。這樣既誤時(shí)間，又浪費(fèi)客戶的樣品。一旦是客戶非常重要的樣品時(shí)，其后果更不可設(shè)想。而甘油保存菌則容易污染。制作穿刺菌時(shí)，可在1。5ml的Tube管中加入瓊脂培養(yǎng)基，把菌體用牙簽穿刺于瓊脂培養(yǎng)基(固體)中，37℃培養(yǎng)一個(gè)晚上后便可使用。穿刺培養(yǎng)菌在4℃下可保存數(shù)個(gè)月，并且不容易污染，便于運(yùn)送。

如果您需要對過表達(dá)或者表達(dá)降低目的基因的細(xì)胞進(jìn)行反復(fù)試驗(yàn)，那么構(gòu)建穩(wěn)定細(xì)胞株是有必要的。
第一，可以減少不同批次實(shí)驗(yàn)中轉(zhuǎn)染效率差異帶來的實(shí)驗(yàn)結(jié)果差異，提高實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性。
第二，構(gòu)建好細(xì)胞系后不必再進(jìn)行瞬時(shí)轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)以及反復(fù)制備質(zhì)粒，減少工作量。
第三，不再使用價(jià)格高昂的轉(zhuǎn)染試劑，節(jié)約實(shí)驗(yàn)成本。

不是所有的細(xì)胞株都能構(gòu)建成為穩(wěn)定細(xì)胞系的。構(gòu)建穩(wěn)定細(xì)胞系需要滿足2個(gè)條件：

1、細(xì)胞能穩(wěn)定傳代；

2、細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率滿足要求。

1.一致性和重復(fù)性高:抗體生產(chǎn)質(zhì)量可控,抗體的批次間差異小。

2.可以避免雜交瘤細(xì)胞制備中如基因丟失、基因突變和細(xì)胞株漂移等問題。

3.靈敏度和特異性強(qiáng):利用重組技術(shù),更容易通過抗體工程提高抗體特異性和靈敏度。

4.高通量、高效率:簡化客戶的抗體發(fā)現(xiàn)流程,以指定形式表達(dá)的優(yōu)質(zhì)抗體滿足您特定的實(shí)驗(yàn)需求。

5.無動(dòng)物體外生產(chǎn)。